Fuerzas Armadas Españolas - El Foro

Abro este tema para discutir una duda que se me plantea, expongo mi caso:

Hace un día, ayer domingo, realicé una Pcr de Covid debido a un positivo en un compañero y a que mi pareja presenta sintomas, he dado negativo, hasta ahí todo correcto, ahora bien, la médica (seguridad social para el que le interese) me dice que tengo que pasar una baja en casa para estar aislado 10 días para prevenir que sea un falso negativo, ahora bien, he comentado esto con mi cabo y me ha dicho que mañana vaya a currar que ya lo comentará a ver que dicen de arriba, la médica por otro lado, me dijo que preguntase lo de la baja porque ellos no tienen ni idea de como va para los militares, que ellos no pueden extender una baja médica porque si.

Mi pregunta son dos:

1º En este caso, que autoridad es la que tengo que acatar? la militar? o la sanitaria? es decir, tengo que acatar lo que me dice la médica o lo que me llega desde mi unidad

2º En caso de que sea lo que dicen en mi unidad y siga yendo a currar "tranquilamente", existe la posibilidad de que se me pueda imponer alguna sanción si un agente de la policía me parase o si alguien me comentase algo de que le salga que estoy de baja? 

En resumen, yo acato lo que me digan que haga, pero no tengo ni idea de en qué situación me pueda dejar eso